- BWV 531 — Прелюдия и фуга До мажор
- BWV 532 — Прелюдия и фуга Ре мажор
- BWV 532a — Фуга Ре мажор (альтернативная версия BWV 532)
- BWV 533 — Прелюдия и фуга Ми минор («Маленькая»)
- BWV 534 — Прелюдия и фуга Фа минор
- BWV 535 — Прелюдия и фуга Соль минор
- BWV 535a — Прелюдия и фуга Соль минор (альтернативная, упрощённая версия BWV 535)
- BWV 536 — Прелюдия и фуга Ля мажор
- BWV 536a — Прелюдия и фуга Ля мажор (альтернативная версия BWV 536, основанная на оригинальной рукописи)
- BWV 537 — Фантазия (прелюдия) и фуга До минор
- BWV 538 — Токката и фуга Ре минор («Дорийская»)
- BWV 539 — Прелюдия и фуга Ре минор
- BWV 539a — Фуга Ре минор (BWV 1000 — её лютневая аранжировка, вторая часть BWV 1001 — скрипичная)
- BWV 540 — Токката и фуга Фа мажор
- BWV 541 — Прелюдия и фуга Соль мажор
- BWV 542 — Фантазия и фуга соль минор («Большая»)
- BWV 542a — Фуга Соль минор (альтернативная версия фуги из BWV 542)
- BWV 543 — Прелюдия и фуга Ля минор
- BWV 544 — Прелюдия и фуга Си минор
- BWV 545 — Прелюдия и фуга До мажор
- BWV 545a — Прелюдия и фуга До мажор (альтернативная версия BWV 545)
- BWV 545b — Прелюдия, трио и фуга Си мажор (альтернативная версия BWV 545)
- BWV 546 — Прелюдия и фуга До минор
- BWV 547 — Прелюдия и фуга До мажор
- BWV 548 — Прелюдия и фуга Ми минор («Большая»)
- BWV 549 — Прелюдия и фуга До минор
- BWV 550 — Прелюдия и фуга Соль мажор
- BWV 551 — Прелюдия и фуга Ля минор
- BWV 552 — Прелюдия и фуга Ми-бемоль мажор («Св. Анна»)
- Восемь маленьких прелюдий и фуг (553—560; ошибочно, возможно, сочинены Иоганном Тобиасом Кребсом)
- BWV 553 — Маленькая прелюдия и фуга До мажор
- BWV 554 — Маленькая прелюдия и фуга Ре минор
- BWV 555 — Маленькая прелюдия и фуга Ми минор
- BWV 556 — Маленькая прелюдия и фуга Фа мажор
- BWV 557 — Маленькая прелюдия и фуга Соль мажор
- BWV 558 — Маленькая прелюдия и фуга Соль минор
- BWV 559 — Маленькая прелюдия и фуга Ля минор
- BWV 560 — Маленькая прелюдия и фуга Си-бемоль мажор
- BWV 561 — Фантазия и фуга Ля минор (ошибочно)
- BWV 562 — Фантазия и фуга До минор (фуга не закончена)
- BWV 563 — Фантазия с имитацией Си минор (ошибочно)
- BWV 564 — Токката, адажио и фуга До мажор
- BWV 565 — Токката и фуга Ре минор
- BWV 566 — Токката и фуга Ми минор (ошибочно)
- BWV 566a — Токката Ми мажор (ранняя версия BWV 566)
- BWV 567 — Прелюдия До мажор
- BWV 568 — Прелюдия Соль мажор
- BWV 569 — Прелюдия Ля минор
- BWV 570 — Фантазия До мажор
- BWV 571 — Фантазия (концерт) Соль мажор (ошибочно)
- BWV 572 — Фантазия Соль мажор
- BWV 573 — Фантазия До мажор (незавершённая, из Нотной тетради Анны Магдалены Бах)
- BWV 574 — Фуга До минор
- BWV 574a — Фуга До минор (альтернативная версия BWV 574)
- BWV 575 — Фуга До минор
- BWV 576 — Фуга Соль мажор
- BWV 577 — Фуга Соль мажор «a la Gigue» (ошибочно)
- BWV 578 — "Малая" органная фуга Соль минор
- BWV 579 — Фуга на тему Арканджело Корелли (из Op. 3, № 4) Си минор
- BWV 580 — Фуга Ре мажор (ошибочно)
- BWV 581 — Фуга Соль мажор (ошибочно, сочинена Гомилиусом)
- BWV 581a — Фуга Соль мажор (ошибочно)
